Le complexe monumental de San Francisco de Lima est un joyau de l'architecture et de l'art colonial péruvien. Chaque coin de la basilique franciscaine et du couvent nous ramène à près de 500 ans d'histoire de la Lima coloniale, républicaine et moderne. Surtout les presque 300 ans de la vice-royauté, quand Lima était le centre du pouvoir espagnol en Amérique du Sud, quand la foi catholique était profondément enracinée dans la vie de tous ses habitants.
C'est l'une des principales attractions touristiques de la ville. Depuis la fondation de la ville de Lima, c'était le siège de la congrégation franciscaine. En 1535, les travaux de construction de l'église principale ont commencé, plus tard le couvent a été construit, étant le plus grand complexe architectural religieux et colonial de la ville.
Actuellement, le couvent est également un musée, grâce à l'énorme richesse artistique qu'il possède, dans ses installations sont conservées des œuvres de grands maîtres de la peinture, tels que Francisco de Zurbarán, et des toiles de l'atelier du grand maître flamand Pieter Paul Rubens. Le musée conserve de nombreux bijoux en or et argent, du mobilier des XVIe et XVIIe siècles,
Ses environnements, préservés au fil du temps, nous permettent de voir des cloîtres ornés de tuiles apportées de Séville, données par la mythique Catalina Huanca, filleule de Francisco Pizarro, l'une des femmes indigènes les plus riches du Pérou à l'époque. Aujourd'hui, le touriste peut visiter presque tout le couvent, admirer ses fontaines, ses arches et ses jardins qui préservent l'atmosphère religieuse franciscaine. Sur les murs de ses salles, chambres, chapelles, ainsi que dans ses patios, des peintures religieuses et des retables sont conservés. La partie la plus attrayante d'une visite à ce musée-couvent est ses cryptes, communément appelées "catacombes", où se trouvent des milliers de crânes et d'ossements, restes des habitants de Lima qui ont choisi, à leur mort, d'être enterrés sous le couvent, croyant qu'il leur garantit la paix éternelle et le pardon de vos péchés. Les "catacombes", comme il y en a beaucoup en Europe, sont un labyrinthe de passages et de portes, qui, selon beaucoup, communiquent avec l'ancien palais du vice-roi du Pérou.
Le couvent conserve l'une des plus belles bibliothèques du Pérou, et dans le monde, il semble le cadre du roman "Le nom de la rose", d'Umberto Eco. Sa bibliothèque, avec une décoration baroque originale, abrite quelque 20 mille volumes, parmi lesquels on trouve de véritables pépites bibliographiques et des éditions rares, des incunables, comme une Bible imprimée au XVe siècle, entre autres livres imprimés avant la découverte de l'Amérique. À l'intérieur également, plus de six mille parchemins sont conservés, qui font l'objet d'études.
La place de San Francisco est un cadre magique, c'est pourquoi elle a été utilisée à plusieurs reprises pour mettre en scène des pièces de théâtre, telles que : "La vie est un rêve" de Pedro Calderón de la Barca, ainsi que le lieu de tournage de plusieurs films.