Le nom Drottningholm (qui signifie littéralement « îlot de la reine ») vient du bâtiment original de la Renaissance conçu par Willem Boy, un palais en pierre construit par Jean III de Suède en 1580 pour sa reine, Catherine Jagiellon. Ce palais était précédé d'un manoir royal appelé Torvesund.
La reine douairière régente Hedwig Eleonora a acheté le château en 1661, un an après la fin de son rôle de reine de Suède, mais il a brûlé complètement le 30 décembre de la même année. Hedwig Eleonora a engagé l'architecte Nicodème Tessin l'Ancien pour concevoir et reconstruire le château. En 1662, débutent les travaux de reconstruction de l'édifice. Le château étant presque terminé, Nicodème mourut en 1681. Son fils Nicodème Tessin le Jeune continua son travail et termina les aménagements intérieurs élaborés. Le sculpteur flamand Nicolaes Millich a réalisé pour le grand escalier et la salle des sculptures des neuf muses en marbre, ainsi qu'une série de bustes de rois gothiques. En outre, il a également réalisé des portraits en buste du roi Charles X Gustav, de son épouse Hedwig Eleonor et de leurs deux fils, le jeune roi Charles XI, probablement aussi de Magnus Gabriel De la Gardie et de son épouse Maria Euphrosyne, une sœur du roi Charles X Gustav. . Millich et son assistant Burchard Precht ont également réalisé des sculptures en bois décoratives dans la chambre à coucher de la reine douairière.
Pendant la période de la reconstruction, Hedwig Eleonora était à la tête de la régence du roi encore mineur, Charles XI de Suède, de 1660 à 1672. La Suède était devenue un pays puissant après la paix de Westphalie. La position de la reine, essentiellement le souverain de Suède, exigeait une résidence impressionnante située à proximité de Stockholm.
Sous le règne des rois Charles XI de Suède et Charles XII de Suède, la cour royale était souvent présente au palais, qui était utilisé pour la chasse. Hedwig Eleonora a utilisé le palais comme résidence d'été jusqu'à sa mort en 1715, également lorsqu'elle était devenue l'hôte incontesté de la cour royale en l'absence de Charles XII lors de la Grande Guerre du Nord (1700-1721).
Drottningholm a continué à servir régulièrement de résidence d'été pour la cour royale pendant tout le XVIIIe siècle. Après la mort de Hedwig Eleonora en 1715, la reine Ulrika Eleonora de Suède et le roi Frédéric Ier de Suède tinrent leur cour au palais en été.
En 1744, le palais fut offert en cadeau par le roi Frédéric Ier à la princesse héritière de l'époque, plus tard reine de Suède, Louisa Ulrika de Prusse lorsqu'elle épousa Adolf Frédéric de Suède, qui devint roi de Suède en 1751. Pendant que Louisa Ulrika était propriétaire de Drottningholm, l'intérieur du palais a été transformé en un style rococo français plus sophistiqué. Louisa Ulrika était également responsable de la reconstruction du théâtre du palais de Drottningholm dans un style grandiose après l'incendie du bâtiment d'origine plus modeste en 1762. Louisa Ulrika et Adolf Fredrick ont continué à résider au palais pendant leur règne (1751-1771). En 1777, Louisa Ulrika vendit Drottningholm à l'État suédois.
Alors qu'il appartenait à l'État suédois, le palais a été utilisé par le roi Gustave III de Suède, fils de Louisa Ulrika, comme résidence d'été, et une grande cérémonie de la cour a eu lieu au palais, qui est considéré comme un grand âge pour le palais, au cours duquel il était connu pour les mascarades élaborées et les grandes festivités théâtrales et les tournois organisés dans les jardins. Pendant le règne de Gustav IV Adolf de Suède (règne 1792-1809) et de Charles XIII de Suède (règne 1809-1818), le palais a été progressivement utilisé de manière plus sporadique. En 1797, ce fut le lieu des grandes festivités où l'épouse du roi, Frédéric de Bade, y fut reçue à son arrivée en Suède, au cours de laquelle le dernier carrousel, ou tournoi, fut organisé dans le jardin du palais. Après le coup d'État de 1809, le déchu Gustave IV Adolf a été gardé ici sous bonne garde dans le salon chinois pendant onze jours.