L'abbaye est classée monument historique par la liste de 1862, qui sauve les principaux monuments historiques de France.
Le site est inscrit deux fois sur la liste du patrimoine mondial de l'UNESCO : une fois en 1979 sous le titre "Le Mont Saint-Michel et sa baie" et une seconde fois en 1998 dans le cadre des "Chemins de Compostelle en France". Il appartient à l'État français et est géré par le Centre des monuments nationaux.
