Le musée archéologique de Thèbes retrace l’histoire de la Béotie du Paléolithique à la période post-byzantine. Réorganisée et ouverte au public en 2015, son exposition occupe environ 1 000 mètres carrés et constitue l’une des meilleures introductions au passé de la Grèce continentale. Sa situation à Thèbes permet de replacer les objets dans une cité qui fut, à plusieurs reprises, un centre politique et culturel majeur.
Parmi les ensembles les plus rares figurent les sceaux-cylindres découverts dans la Chambre du Trésor du palais mycénien de Thèbes. Ces petits objets renseignent sur l’administration, les échanges et les contacts lointains à l’âge du Bronze. Le musée conserve également les larnax en terre cuite peinte provenant de Tanagra, des sarcophages dont le décor constitue un phénomène exceptionnel en Grèce continentale. Le parcours se poursuit à travers les époques classique, hellénistique, romaine, byzantine et postérieure.