Le palais se trouve près du rivage de Kato Zakros, où une baie reliait l’est de la Crète à Chypre, l’Égypte et au Levant. Le complexe d’environ 8 000 m² comprenait cour centrale, magasins, ateliers, salles cérémonielles et dispositifs hydrauliques sophistiqués. Sa destruction finale vers 1450 av. J.-C. laissa d’importants dépôts inviolés, livrant des ensembles cohérents.
Un premier palais se développa vers 1900 av. J.-C. et fut largement rebâti à la période néopalatiale. Nikolaos Platon lança les fouilles systématiques en 1961. Ville environnante et nécropoles de la gorge des Morts montrent que le palais appartenait à une communauté et un paysage plus vastes.