Le parc national de Manú se découvre comme une traversée d’écosystèmes, et non comme un simple belvédère ou une excursion facile depuis Cusco. Dans le sud-est du Pérou, son bassin protégé descend des Andes orientales vers l’Amazonie, en traversant prairies d’altitude, forêt de nuages, forêts yungas et forêt tropicale de plaine. L’UNESCO indique une superficie de 1 716 295 hectares et un dénivelé allant d’environ 350 mètres à plus de 4 000 mètres. Cette transition explique la diversité des habitats réunis dans un paysage continu.
Le parc couvre des secteurs de Cusco et de Madre de Dios, notamment les provinces de Paucartambo et de Manú. Son réseau fluvial relie les torrents de montagne au río Manú puis, plus au sud, au río Madre de Dios. Le terrain est isolé et difficile d’accès ; l’UNESCO décrit le bien comme encore dépourvu de routes. Cet éloignement a limité certains impacts extérieurs, mais il implique aussi du temps, des transports autorisés et un itinéraire conçu pour un secteur touristique précis.
