Les vestiges du temple d’Apollon Pythien se trouvent dans la ville basse de l’ancienne Gortyne, dans la plaine crétoise de la Messara. Ils appartiennent à un paysage archéologique bien plus vaste que le secteur très visité de l’Odéon et du Code de Gortyne. Le sanctuaire n’était pas seulement religieux : inscriptions et traités en faisaient une archive publique et un lieu où la cité mettait son autorité en scène.
Le ministère grec de la Culture évalue l’emprise de Gortyne à quelque 4 000 stremmata. Les monuments du parcours payant habituel n’en représentent qu’une partie. Le Pythion se trouve dans le secteur méridional, près du temple des divinités égyptiennes et d’un petit théâtre. Les conditions d’accès diffèrent selon les zones ; un billet général ne garantit pas l’entrée dans chaque ruine figurant sur une carte.