Le Biotope protégé Naachtún–Dos Lagunas se trouve au nord du Petén, dans les zones centrales de la Réserve de biosphère maya. Forêt, zones humides saisonnières et rares eaux douces soutiennent la faune, tandis que les paysages archéologiques voisins conservent établissements et chaussées mayas.
Le CONAP enregistre Dos Lagunas sur 30 719 hectares, déclaré en 1990. Il forme un paysage continu avec le parc Mirador–Río Azul et les forêts vers le Mexique et le Belize. C’est un territoire protégé éloigné, non un parc autoguidé.