San José Mogote, dans la branche d’Etla des Vallées centrales, éclaire le passage du village à l’organisation politique régionale. L’occupation commence vers 1500 av. J.-C. et le site devient un centre majeur au Préclassique moyen. L’INAH l’associe à la concentration du pouvoir, du culte et des échanges avant Monte Albán.
L’étiquette « zone archéologique » peut évoquer un parc monumental. Les vestiges sont pourtant imbriqués dans la communauté actuelle et l’ancienne Hacienda del Cacique. Depuis 1964, les fouilles ont livré maisons, architecture publique, artisanat et monuments sculptés, mais beaucoup se lit par l’archéologie plutôt que par de hautes ruines.